พลเอกประยุทธ์ จันทร์โอชา นายกรัฐมนตรีและรัฐมนตรีว่าการกระทรวงกลาโหม เปิดเผยว่าได้สั่งการให้หน่วยงานที่เกี่ยวข้อง ดูแลความเรียบร้อยหลังเกิดเหตุลอบวางระเบิดที่จังหวัดยะลาเมื่อคืนที่ผ่านมาแล้ว และได้กำชับให้เจ้าหน้าที่เร่งติดตามสอบสวนหาตัวผู้กระทำความผิด มาลงโทษโดยเร็ว รวมถึงให้ดูแลผู้ที่ได้รับบาดเจ็บตามระเบียบและขั้นตอนที่มีอยู่
ขณะที่พลเอกประวิตร วงษ์สุวรรณ รองนายกรัฐมนตรี บอกว่าเสียใจกับเหตุการณ์ที่เกิดขึ้น ซึ่งทำให้มีทั้งผู้บาดเจ็บและเสียชีวิต ยืนยันว่าที่ผ่านมารัฐบาลพยายามทำทุกอย่าง โดยเฉพาะในเรื่องของการเฝ้าระวังและป้องกันเหตุ ยอมรับว่าจำเป็นต้องเพิ่มความระมัดระวังมากขึ้นและต้องให้ประชาชนเข้ามามีส่วนร่วมมากกว่านี้ ขณะเดียวกันก็จะเดินหน้าพูดคุยสันติสุขต่อไป โดยขณะนี้หัวหน้าคณะพูดคุยยังเป็นคนเดิมคือพลเอกอุดมชัย ธรรมสาโรรัชต์ แม้เจ้าตัวจะยื่นใบลาออกแล้วก็ตาม
พลเอกประวิตรเชื่อว่า การก่อเหตุในครั้งนี้ไม่เกี่ยวข้องกับข้อเสนอของบีอาร์เอ็นที่ขอให้ปล่อยตัวผู้ก่อเหตุในสามจังหวัดชายแดนภาคใต้ทั้งหมด และไม่เกี่ยวกับเหตุระเบิดป่วนกรุงเทพฯก่อนหน้านี้ ขออย่านำเหตุการณ์มาเชื่อมโยงกัน ซึ่งล่าสุดทราบว่าเจ้าหน้าที่สามารถจับกุมและดำเนินคดีกับผู้ที่กระทำผิดได้ทั้งหมดแล้ว